FTHFS 基因 Sequencing
formyltetrahydrofolate synthetase (FTHFS) 基因為共營乙酸氧化菌(SAOB)中,行W-L pathway 的一個重要之功能性基因,在文獻中多簡寫成FTHFS
目前被認為是SAOB的只有5種菌,為Pseudothermotoga lettingae、 Thermacetogenium phaeum、Clostridium ultunense、Syntrophaceticus schinkii 及Tepidanaerobacter acetatoxydans
經過一些預備搜尋後,發現在資料庫中,Gene description為fomate-tetrahydrofolate ligase的項目中,Gene symbol 有兩種,分別為fthfs及fhs,這次搜尋以fhs作為關鍵字
在 Nucleotide 搜尋中 瀏覽過搜尋結果後,和心中預期的有點不合,但由於目前對於SAOB之研究較少,有許多含有FTHFS基因之細菌皆未被認定為SAOB
於是挑了兩個菌,和先前我在AHS反應槽中選殖出之菌一樣或在同一屬
於是挑了兩個菌,和先前我在AHS反應槽中選殖出之菌一樣或在同一屬
為Clostridium kluyveri DSM 555(LOCUS:CP000673) 及Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73(LOCUS:CP004069),點入Genebank後,可以看到關於此基因的一些資料,包含這些菌在生物學上之分類,來源,發表文章的題目等等,在此我特別關注發表的題目,由於FTHFS基因為進行一個特殊pathway中的一個重要基因,像當我看到title為"The genome of Clostridium kluyveri, a strict anaerobe with unique metabolic features"
可以知道他的一些文獻相關資訊,將文獻拿出來回顧。
在ORGANISM中可以知道他們全都是Firmicutes 門的,整體來說,在nucleotide搜尋中找到許多fthfs基因,
在Gene搜尋中
可以知道他的一些文獻相關資訊,將文獻拿出來回顧。
在ORGANISM中可以知道他們全都是Firmicutes 門的,整體來說,在nucleotide搜尋中找到許多fthfs基因,
在Gene搜尋中
"fomate-tetrahydrofolate ligase [ Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1 ]"
Gene ID: 933045, updated on 12-Jan-2017 為最近發表之一個菌,在Firmicutes門,
和先前我在AHS反應槽中選殖出之fthfs gene 落在同一門中
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