Microarray分析軟體 Multiple experiment viewer
1.選取檔案(MeV_4_9_0)，並且開啟，開啟後會有三個視窗，黑色框框的(MeV.exe)為原始檔案，不可關閉，在位階上 exe>MultExperiment Viewer>Multiple Viewer 2.接著選取檔案，這次用的檔案是老師提供之檔(gpr)，然後全部載入，這個分析軟體可以分析比較2組數據以上之關係 gpr檔案用excel打開長這樣 選取檔案流程:File>Load data>select file Loader>Other Format File>Genepix format>Browse(此處是選取目標檔案所在之資料夾，並在軟體中開啟資料夾)>add(or add all) ps.軟體版本不同，操作介面按鍵也會有所不同，若版本更新就在自己摸索一下即可 3.將data normalization ，在normalization前後，數據之數值會改變，但排位一定不變 流程:Adjust Data>Normalization>Total Intensity 點完之後圖片會立即改變(稍縱即逝，要注意看變化) HCL分析 Analysis>Clustering>HCL ·Gene tree 分析完之後點取左邊之HCL(1) 可以看到分析之結果 目前對於此分析之用途尚不清楚，只知道越紅色其相關性越高，綠色則越低 4.K-mean分析 設立分群，可以自行決定要分成幾群，但實際數據的意義，我還不是很懂，先把流程記下來，以後會懂得 流程:(要用original檔案):Analysis>Clustering>KMS ·Cluster gene ////即用基因分組，若選 sample 則是用樣本分組 V:Construct Hierarchical Trees 一樣點取KMS就可以看檔案 5.CAST 也可以由電腦決定要分成幾群，用密度法